在名为“十三号试验区”的人间地狱，灵体融合实验沦为血腥屠杀的导火索。拥有灵体感知与危险预见异能的林屿，与具备超强体能和自愈力的江彻，是彼此唯一的慰藉与依靠。实验体04失控化作怨灵的那一刻，两人撞破培养舱，在猩红警报与尸骸遍地的通道中踏上逃亡之路。

从雾锁空城的废弃都市，到夜半童谣萦绕的诡异小镇；从地下溶洞的囚笼绝境，到血色十字架的教堂陷阱；从镜中魅影的精神折磨，到雨夜凶铃的追兵围剿，他们穿越灵体污染肆虐的废墟，对抗被异化的“影子”、改造人军队与操控生死的实验体，灵体污染的黑纹在江彻身上不断蔓延，林屿的异能也在透支中濒临失控。

途中，他们邂逅操控植物的实验体苏念——灵体之源核心“烬”的妹妹。得知“烬”已被灵体吞噬理智，欲吸收所有实验体异能成为“灵体之神”，三人结伴同行，却在荒漠鬼城遭遇流沙，苏念为护二人牺牲，留下能削弱“烬”力量的植物种子。

带着种子与同伴的遗愿，林屿与江彻闯血色祭坛，破灵体符文，直面被灵体包裹的“烬”。江彻以肉身抵挡致命攻击，林屿在绝望中爆发，将种子融入纯净异能，刺穿“烬”的核心，终结了灵体污染的根源。

然而灵体反噬不可逆，江彻的自愈力彻底失效，在约定的“自由之地”野花坡溘然长逝；林屿的身体逐渐透明，意识化作灵体，在无声的告别中守护着重获和平的世界。多年后，小镇的微光公园中，两缕灵体能量相互缠绕，化作永不凋零的白花，见证着这段跨越生死的友情，与用生命换来的自由微光。